Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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