Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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TRAF1Q13077 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TRAF1Q13077 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TRAF1Q13077 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TRAF1Q13077 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TRAF1Q13077 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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TRAF1Q13077 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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