Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK2Q13002 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK2Q13002 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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