Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF2Q12947 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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