Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC10A2Q12908 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms