Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RASGEF1BQ0VAM2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RASGEF1BQ0VAM2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RASGEF1BQ0VAM2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RASGEF1BQ0VAM2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RASGEF1BQ0VAM2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RASGEF1BQ0VAM2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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