Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CAMSAP2Q08AD1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP2Q08AD1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP2Q08AD1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP2Q08AD1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms