Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNDQ07001 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms