Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBE1Q04446 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms