Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CENPCQ03188 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms