Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAV1Q03135 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAV1Q03135 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms