Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms