Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms