Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF8Q02556 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms