Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYP27A1Q02318 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms