Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HSF1Q00613 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HSF1Q00613 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms