Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms