Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA4Q00056 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA4Q00056 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms