Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB2P80303 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUCB2P80303 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms