Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HBBP68871 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HBBP68871 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HBBP68871 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms