Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms