Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPS29P62273 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPS29P62273 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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