Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms