Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP4BP1P59074 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms