Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FBXW4P57775 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms