Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms