Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms