Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCR4P51679 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCR4P51679 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCR4P51679 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCR4P51679 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCR4P51679 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCR4P51679 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCR4P51679 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCR4P51679 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCR4P51679 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCR4P51679 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCR4P51679 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCR4P51679 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCR4P51679 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCR4P51679 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms