Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERFP50548 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERFP50548 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERFP50548 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERFP50548 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERFP50548 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERFP50548 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERFP50548 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERFP50548 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERFP50548 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERFP50548 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERFP50548 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERFP50548 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms