Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNMTP50135 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNMTP50135 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNMTP50135 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HNMTP50135 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms