Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTPAP49638 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTPAP49638 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TTPAP49638 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTPAP49638 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTPAP49638 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTPAP49638 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TTPAP49638 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTPAP49638 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TTPAP49638 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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