Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A3P48751 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms