Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLCP48506 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLCP48506 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GCLCP48506 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCLCP48506 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GCLCP48506 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCLCP48506 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCLCP48506 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GCLCP48506 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCLCP48506 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms