Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms