Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP5P45974 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP5P45974 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP5P45974 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP5P45974 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP5P45974 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms