Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL35P42766 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL35P42766 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL35P42766 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL35P42766 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL35P42766 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL35P42766 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL35P42766 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL35P42766 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL35P42766 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL35P42766 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL35P42766 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL35P42766 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL35P42766 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL35P42766 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL35P42766 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms