Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3CBP42338 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms