Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms