Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDIT3P35638 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDIT3P35638 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms