Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPC1P35052 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPC1P35052 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC1P35052 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms