Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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CASQ1P31415 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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CASQ1P31415 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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CASQ1P31415 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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CASQ1P31415 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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CASQ1P31415 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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CASQ1P31415 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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CASQ1P31415 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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CASQ1P31415 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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