Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC12P31275 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms