Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms