Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP1P29466 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASP1P29466 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CASP1P29466 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASP1P29466 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASP1P29466 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP1P29466 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms