Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD34P28906 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD34P28906 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms