Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NFKBIAP25963 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms