Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT1P21579 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT1P21579 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT1P21579 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYT1P21579 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT1P21579 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT1P21579 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms