Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASTP20810 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASTP20810 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASTP20810 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASTP20810 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASTP20810 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASTP20810 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASTP20810 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms