Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDSP20132 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDSP20132 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SDSP20132 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SDSP20132 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDSP20132 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDSP20132 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDSP20132 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms