Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNNI3P19429 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms